Ph.d.-forsvar ved Christian Thomsen
Immunhistokemi (IHC) er en central metode inden for patologi, som gør det muligt at visualisere proteiner i vævsprøver til forskning og klinisk diagnostik. Da IHC-resultater kan have betydning for diagnose, prognose og behandlingsbeslutninger, er høj nøjagtighed af IHC-analyser afgørende. En væsentlig udfordring ved vurdering af IHC opstår, når forskellige antistoffer mod det samme mål giver modstridende resultater. En foreslået metode til at afklare sådanne uoverensstemmelser er at sammenligne proteinekspression med den rumlige ekspression af det tilsvarende mRNA. Nytten af rumlig mRNA-analyse til vurdering af IHC-specificitet er dog endnu ikke tilstrækkeligt undersøgt.
I sin ph.d.-afhandling undersøger Christian Thomsen, om rumlig mRNA-ekspression kan anvendes som et generelt redskab til at vurdere IHC-specificitet. Afhandlingen består af tre studier.
Det første studie sammenlignede to teknologier til rumlig mRNA-analyse, RNAscope og GeoMx Spatial Transcriptomics. RNAscope havde højere sensitivitet og opløsning på enkeltcelleniveau, mens GeoMx gjorde det muligt at analysere tusindvis af gener samtidigt.
Det andet studie undersøgte sammenhængen mellem mRNA- og proteinekspression for 36 biomarkører i brystkræft. Der blev observeret betydelig variation, hvilket viste, at mRNA-ekspression ofte, men ikke altid, forudsiger proteinekspression målt ved IHC.
Det tredje studie undersøgte, om mRNA in situ-hybridisering kunne anvendes til at vurdere specificiteten af den diagnostiske biomarkør TRPS1. Resultaterne bekræftede høj teknisk specificitet og gav indsigt i forholdet mellem sensitivitet og specificitet.
Samlet viser afhandlingen, at rumlig mRNA-analyse er et værdifuldt supplement til de metoder, der er tilgængelige til validering af IHC. Selvom metoden ikke kan anvendes universelt, kan den bidrage med vigtig dokumentation for antistoffers specificitet og dermed medvirke til mere pålidelig diagnostik og biomarkørforskning.
Tid og sted
Ph.d.-forsvaret finder sted onsdag den 11. november 2026 kl. 13.00 i lokale 11.01.032A, Aalborg Universitet, Selma Lagerløfs Vej 249, 9260 Gistrup. Alle er velkomne.
Vejledere og bedømmelsesudvalg
- Lektor Rasmus Røge, Patologiafdelingen, Aalborg Universitetshospital og Klinisk Institut, Aalborg Universitet (hovedvejeder)
- Bioanalytiker Søren Nielsen, Patologiafdelingen, Aalborg Universitetshospital
Bedømmelsesudvalg
- Lektor Johanne Lade Keller (forperson), Aalborg Universitet
- Professor Lise Mette Rahbek Gjerdrum, Københavns Universitet
- Professor Patrick Micke, Uppsala Universitet, Sverige