Ph.d.-forsvar ved Karina Frahm Kirk
Ætiologien bag kronisk inflammatorisk tarmsygdom (IBD) er ukendt. Den generelle opfattelse er dog, at sygdommen skyldes et uhensigtsmæssigt immunrespons udløst af en eller flere mikroorganismer, hos genetisk præ-disponerede individer. In-vitro studier har vist, at bakterien Campylobacter concisus har flere patogene egenskaber, der kan medføre invasion og øde-læggelse af epitelceller med opregulering af det inflammatoriske respons i tarmen til følge.
Campylobacter concisus har tidligere har været associeret til gastrointestinale sygdomme, såsom langvarig diarré og IBD og tidligere studier har fundet en højere forekomst af C. concisus DNA i prøver fra patienter med IBD sammenlignet med raske. Studier, der har påvist levende C. concisus ved dyrkning fra tarmbiopsier, er sparsomme.
Til studierne i denne ph.d.-afhandling indsamlede Karina Frahm Kirk spyt, afføring og tarm- biopsier til undersøgelse for C. concisus, fra i alt 87 personer. Hun beskrev en ny dyrkningsmetode af C. concisus fra biopsier, med hvilken hun fandt, at antallet af personer med levedygtige C. concisus i tarmen var høj, både hos IBD patienter og hos raske. Patienter med IBD der havde de mest udtalte kliniske symptomer havde en højere forekomst af C. concisus sammenlignet med de øvrige grupper, hvilket kunne antyde, at en større mængde bakterier er sygdomsassocieret.
Udvalgte C. concisus isolater blev analyseret ved hel-genom-sekventering med efterfølgende typning af forskellige gensekvenser. Isolaterne fordelte sig i to genomospecies, der ikke viste association til den kliniske tilstand. Det var tydeligt, at individer kan koloniseres af flere forskellige C. concisus stammer, selv i samme lokalisation. Karina Frahm Kirk undersøgte genomerne for potentielle virulens-gener, tidligere beskrevet for C. concisus. Her var der ligeledes ingen forskel mellem grupperne og dermed heller ingen association til den kliniske tilstand.
Afhandlingen bidrager med en detaljeret beskrivelse af en større samling C. concisus isolater fra tarmbiopsier, der ikke tidligere er opnået. I øvrigt belyses forekomsten og heterogeniteten af C. concisus i forskellige kliniske tilstande, og hos den enkelte.Tid og sted
Ph.d.-forsvaret finder sted fredag den 31. marts 2017 kl. 14.00 i auditoriet, Forskningens Hus, Aalborg Universitetshospital. Efterfølgende vil der være reception. Alle er velkomne.
Vejledere og bedømmelsesudvalg
Vejledere- Henrik Nielsen, Professor, dr. med., Infektionsmedicin, Aalborg Universitetshospital
- Hans Linde Nielsen, læge, ph.d., Klinisk Mikrobiologi, Aalborg Universitetshospital
- Ole Thorlacius-Ussing, Professor, dr. med. , Kirurgisk Gastroenterologi, Aalborg Universitetshospital
Bedømmelsesudvalg
- Dr. Georgina Hold, BSc, PhD, School of Medicine, Medical Sciences and Nutrition University of Aberdeen, Institute of Medical Sciences, Scotland, United Kingdom
- Andreas Munk Petersen, Overlæge, ph.d., Medicinsk Gastroenterologisk Afdeling, Hvidovre Sygehus, Region Hovedstaden