Ph.d.-forsvar ved Ida Egendal
Kræft i æggestokkene er fortsat forbundet med høj mortalitet, og præcis identifikation af patienter, der har gavn af målrettet behandling, er afgørende for at forbedre kliniske resultater.
enne ph.d.-afhandling undersøger anvendelsen af avancerede genomiske analysemetoder til identifikation af homolog rekombinationsdeficiens (HRD), en central prædiktiv biomarkør for respons på platinbaseret kemoterapi og PARP-hæmmere. HRD identificeres i klinisk praksis ofte via BRCA1/2-mutationer, men den biologiske HRD-fænotype omfatter også tumorer uden påviselige BRCA-mutationer. Dette skaber et klinisk behov for mere sensitive og brede biomarkører, der kan identificere HRD på tværs af genetiske mekanismer.
Afhandlingen evaluerer moderne kunstig intelligens-baserede modeller, herunder variational autoencoder-metoder, til ekstraktion af mutationssignaturer fra helgenomsekventerede tumorer. Disse signaturer afspejler de underliggende DNA-processer der har været aktive i kræftsygdommen og kan dermed anvendes til at påvise HRD. Resultaterne viser, at autoencoder-baserede mutationssignaturer kan identificere HRD med høj præcision og er signifikant associeret med forbedret progressionsfri overlevelse hos patienter behandlet med platinbaseret kemoterapi.
Metoderne muliggør stratificering af BRCA-negative patienter i klinisk relevante undergrupper, hvor HRD positive patienter udviser behandlingsrespons sammenlignelig med BRCA-muterede patienter. På sigt kan disse resultater bidrage til en mere præcis patientselektion til platinbaseret behandling og PARP-hæmmere.
Tid og sted
Ph.d.-forsvaret afholdes fredag den 9. januar, kl. 12.00 i lokale 11.01.032C, Selma Lagerløfs Vej 249, 9260 Gistrup. Alle interesserede er velkomne.Vejledere og bedømmelsesudvalg
Vejledere
- Professor Martin Bøgsted, Aalborg University and Aalborg University Hospital, Denmark
- Associate Professor Rasmus Froberg Brøndum, Aalborg University and Aalborg University Hospital, Denmark
- Professor Karen Dybær, Aalborg University and Aalborg University Hospital, Denmark
- Professor Inge Søkilde, Aalborg University and Aalborg University Hospital, Denmark
Bedømmelsesudvalg
- Professor Carl Herrmann, Heidelberg University, Germany
- Professor Jakob Skou Pedersen, Aarhus University, Denmark
- Associate Professor Thomas Kronborg Larsen, Aalborg University, Denmark