Ph.d.-forsvar ved Jaco Botha

Jaco Botchas ph.d.-afhandling er baseret på fire studier, som har til formål at undersøge indflydelsen af præanalytiske og analytiske aspekter af flowcytometrisk karakterisering af extracellulære vesikler (EV’er), der er en heterogen gruppe af biologiske nanopartikler, som frigives af alle celler, findes i alle biologiske væsker samt udviser stort diagnostisk og terapeutisk potentiale.

I studie 1 undersøgtes 3 flowcytometres resolutionsevne for partikler i EV-størrelsesordenen, deres detektion af forskellige EV-fænotyper og variabilitet i kvantificering af disse inden for samme dag og mellem analysedage.

I studie 2 undersøgtes, hvorvidt aggregater af fluorescerende antistoffer og proteinmarkører kan detekteres ved høj-sensitiv flowcytometri og sammenlignede i hvilken grad højhastighedscentrifugering og filtrering implementeret før farvning kunne reducere disse aggregater.

I studie 3 optimeredes en farvningsprotokol til store lipoproteiner, inklusiv VLDL (very-low density lipoproteins) og kylomikroner. Jacob Botcha undersøgte i hvilken grad disse nanopartikler interfererer med resultater fra EV-studier, hvor lipidbaserede metoder bruges til at definere EV’er.

I studie 4 præsenteres en systematisk metode til optimering af analytiske, hvor den nedre resolutionsgrænse bestemmes i standardiserede enheder, samt hvordan dette kan bruges til at definere optimale indstillinger til brug ved detektion af svage signaler fra nanopartikler som EV’er.

Artiklerne i denne afhandling bidrager til en voksende litteratur omhandlende definering af og løsninger til de faldgruber der er forbundet med EV-forskning og standardisering af metoder og rapportering. Specifikt adresseres flere vigtige præanalytiske og analytiske udfordringer vedrørende flowcytometrisk karakterisering af EV’er som kan have indflydelse på fortolkning af resultater.

Tid og sted

Ph.d.-forsvaret afholdes den 11. januar kl. 13:00-16:00, og kan følges online via Zoom: https://aaudk.zoom.us/j/62269079787

Vejledere og bedømmelsesudvalg

Vejleder

• Professor Aase Handberg, Department of Clinical Medicine, Aalborg University

Bedømmelsesudvalg

• Associate Professor Pablo Pennisi, Department of Health Science and Technology, Aalborg University, Denmark

• Professor Victoria Weber, Department of Biomedical Research, Danube University Krems, Austria

• Senior Scientist Jan Trige Rasmussen, Department of Molecular Biology and Genetics, Aarhus University, Denmark