Ph.d.-forsvar ved Søren Jepsen

Den 22. juni forsvarer cand.scient.med., Søren Jepsen, fra Klinisk Biokemi sin ph.d.-afhandling med titlen Back Scatter Interferometric Sensor for Label-free Medical Diagnostic Assays.

Om ph.d.-afhandlingen

'Back Scatter Interferometry' (BSI) er en optisk målemetode, der er blevet anvendt til at detektere bindinger imellem proteiner, ioner og andre ligander. Metoden, der ikke kræver nogen form for radioaktive eller fluorecerende labels, er derfor en potentiel afløser til de traditionelle immunkemiske metoder, der i dag anvendes til blodprøveanalyser inden for klinisk biokemi. Udgangspunktet for dette projekt var derfor at undersøge BSI’s anvendelighed på tre typer af biokemiske reaktioner; antigen-antistof, protein-ligand, samt enzymatiske reaktioner.

Resultaterne fra dette projekt viser, at BSI kan måle meget små ændringer i brydningsindekset, men ingen af de undersøgte protein-ligand par gav målbare ændringer i brydningsindekset, der kunne tilskrives en bindingsreaktion, hvilket er i uoverensstemmelse med mange af de tidligere publicerede studier, der beskriver BSI som værende en universel detektor for protein-ligand systemer.

For at belyse uoverensstemmelserne mellem resultaterne fra dette projekt og tidligere publicerede studier undersøges BSI’s optiske virkemåde i detaljer samt effekten fra variationer i temperatur og prøve-flow.

Som noget nyt er det lykkedes at detektere den enzymatiske omdannelse af glukose til glukose-6-phosphat, samt dephosphoryleringen af ATP ud fra ændringer i brydningsindekset. Enzymatiske reaktioner er bredt anvendte inden for klinisk biokemi samt mange industrielle processor, og BSI er derfor et spændende alternativ til eksisterende metoder.

 

Tid og sted

Onsdag den 22. juni, kl. 14.00
Auditoriet 2.sal ”Kantinegangen”, rum: 16.04.079,
Aalborg Universitetshospital

Efterfølgende vil Klinisk Biokemi være vært ved en reception.

 

Vejledere og bedømmere

Vejledere

Søren Risom Kristensen, DMSc
Klinisk Professor
Klinisk Institut
Aalborg Universitetshospital og Aaborg Universitet

Henrik Schiøtt Sørensen, PhD
Tidl. Seniorforsker
DTU Fotonik
Danmarks Tekniske Universitet

Thomas Martini Jørgensen
Seniorforsker
DTU Compute
Danmarks Tekniske Universitet

Torleif Trydal, MD
Tidl. Klinsik Biokemi
Aalborg Universitetshospital

Bedømmere

Dmitry Markov, PhD
Research Assistant Professor
Dept. of Biomedical Engineering
Vanderbilt University, USA

Henrik Karstoft, PhD
Professor (Docent)
Institut for Ingeniørvidenskab – Signal Processing
Aarhus Universitet

Aase Handberg, DMSc
Professor
Klinisk Institut
Aalborg Universitetshospital og Aaborg Universitet